有没有一种集通量、速度、成本及精确于一身的SNP检测方法?还有从样品处理
来源:    发布时间: 2017-09-20 11:57   1699 次浏览   大小:  16px  14px  12px
有没有一种

有没有一种集通量、速度、成本及精确于一身的的SNP检测方法?还有从样品处理到结果分析的一站式检测服务?
样品变异位点(SNP和Indel)的检测已经广泛应用于动植物、微生物的基因定位研究。研究者根据样品的特殊性及研究的特点,相继开发了测序法、质谱法及探针法等。而今天小编给大家介绍一种,适合高通量、更快速度、更低成本以及更加精确的新方法。其实这个方法也不算新了,人们使用这个方法定位了很多功能基因,并已发表多篇高水平文章。既然这个方法这么好,那么下面小编就给大家简单地介绍下KASP基因分型技术,以及博美达一站式SNP检测服务。
 
KASP基因分型技术介绍
 
KASPTM指竞争性等位基因特异性PCR (Kompetitive Allele Specific PCR),是一种针对已知SNP位点分析的高效基因分型技术,可对目标SNPs和InDels进行精准的双等位基因分型。通过两个位点特异探针以及2个荧光探针来检则多个SNP位点,以及利用全自动一体化DNA抽提及荧光定量PCR工作平台,可以快速检测大量SNP位点,在医学及农学检测方面KASP都有非常多的应用。


博美达KASP技术平台优势
 
1、分型结果准确
准确度>99.8%
行业里领先的SNP和InDel分析转化率(90%)。基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,不同的SNP模板对应不同的荧光产物。
 
2、检测成本低
不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了试剂成本。合成的探针可用于上千样本的检测。
 
3、节省样品
每个SNP检测仅需样本1-10ng DNA (根据人类基因组大小测算)。
 
4、检测时间短
全自动的工作平台及超大通量,使得实验最短的时间内完成检测。
 
5、检测通量高
自动一体化DNA抽提、荧光定量PCR工作平台,使得能够批量操作96通道或384通道样品,处理及加样的一致性较好,实现大量样品及位点检测。
 
6、一站式服务
从提供生物样本开始,进行探针设计、DNA抽提、检测到分析结果。提供省心省力的一站式服务。
 


参考文献
Development of SNP Genotyping Assays for Seed Composition Traits in Soybean Gunvant Patil, Juhi Chaudhary, Tri D. Vuong, Brian Jenkins, Dan Qiu, Suhas Kadam, Grover J. Shannon, Henry T. Nguyen Int J Plant Genomics. 2017; 2017: 6572969. Published online 2017 May 25.
 
A KASP Genotyping Method to Identify Northern Watermilfoil, Eurasian Watermilfoil, and Their Interspecific Hybrids
Eric L. Patterson, Margaret B. Fleming, Kallie C. Kessler, Scott J. Nissen, Todd A. Gaines Front Plant Sci. 2017; 8: 752. Published online 2017 May 8.
 
Validating DNA Polymorphisms Using KASP Assay in Prairie Cordgrass (Spartina pectinata Link) Populations in the U.S.Hannah Graves, A. L. Rayburn, Jose L. Gonzalez-Hernandez, Gyoungju Nah, Do-Soon Kim, D. K. Lee Front Plant Sci. 2015; 6: 1271. Published online 2016 Jan 22.
 
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